Giống như trong bất kỳ cuộc thi đấu nào, 'gian lận' để tăng điểm cống hiến cho hệ thống là hoàn toàn có khả năng. Để chống lại những thành phần này, hệ thống SETI@Home gửi mỗi workunit cho nhiều máy tính khác nhau, được cấu hình với giá trị "initial replication" (hiện bằng 2). Điểm cống hiến chỉ được công nhận khi mỗi workunit trả về có chỉ số cùng kết quả với kết quả từ các máy khác bằng "minimum quorum" (hiện bằng 2). Nếu, vì lý do tính toán sai hoặc gian lận ra một kết quả sai, không đủ điểm "minimum quorum", workunit loại đó sẽ được gửi đi để các thành viên khác tính toán cho đến khi workunit đó đạt đủ điểm. Điểm cống hiến được tính cho các máy tính gửi về cùng kết quả. Điểm cống hiến này cũng được tính toán một cách đa dạng tùy theo các bộ vi xử lý khác nhau.[cần dẫn nguồn]

Một vài thành viên sử dụng SETI@home trên những máy tính nơi họ làm việc — và được gọi là 'Borging', giống hình tượng Borg trong Star Trek. Trong một vài trường hợp, người dùng đã dùng các tài nguyên của công ty để chạy chương trình — kết quả là có ít nhất hai trường hợp bị đuổi việc do chạy SETI@home trong hệ thống công ty.[19] Đã có một bài viết trong alt.sci.seti nói về vấn đề "Bất cứ ai cũng có thể bị sa thải vì SETI screensaver" vào ngày 14 tháng 9 năm 1999.

Một số người khác thu thập một lượng lớn các thiết bị với nhau tại nhà để tạo ra "cánh đồng SETI", thường bao gồm một số máy tính chỉ chứa bo mạch chủ, CPU, RAM và nguồn chỉ chạy Linux hoặc các bản Microsoft Windows cũ mà không có màn hình.[20]